一、管辖法院的选择
要起诉医院，首先就要确定到哪个法院起诉，也就是法院管辖问题。一般来说，医疗纠纷诉讼都在区、县层级的基层法院，除非把诉讼标的刻意提高到上千万，才可能到中级法院立案，但这样做得不偿失，因为法院非但判不了这么多，当事人还要搭上不菲的诉讼费。
一般来说，医疗纠纷诉讼多归医疗机构所在地法院管辖，这是法定管辖，当事人无法选择，而当地法院与医疗机构的关系是大部分患方当事人所忌惮的。
但是，历经多家医疗机构诊治，特别是跨省市的，选择法院管辖就需要讲究。夸张一点说，有时法院管辖的选择就决定了案件的胜败。
二、案由的选择
由于对鉴定的态度以及法律适用的有所不同，医疗纠纷还存在案由的选择问题，但各地法院对此有不同的处理。
在上海，不管选择什么案由，医疗纠纷一般都必须由医学会鉴定，且都适用 《医疗事故处理条例》。在上海以外的其他地方，比如北京，既可以选择医疗事故也可以选择医疗过错作为案由。
事实上，医疗纠纷涵义并不明确，案由选择还是有文章可做的，有时还能决定案件的胜负。
三、争取避开医疗鉴定
医疗事故技术鉴定，实践中在患者心目中往往欠缺公信力和权威性，提起医疗诉讼后，患者方一般都反对由医学会进行医疗鉴定。
在实行医疗纠纷双轨制的地方，绕开医学会鉴定问题不大，但在规定医疗纠纷一律进行医学会鉴定的地方(比如上海)，医疗鉴定似乎避无可避。但深究起来其实还是有空子可钻，这就是挑病历的毛病。
因为根据医疗事故处理条例，如果医院的病历不真实，医学会不得进行鉴定。根据举证规则，医疗侵权纠纷，医院负有举证责任。医学会不鉴定，意味着被告举证不能，被告就要承担民事责任。
